Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS5Q9UPZ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms