Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM35Q9UPQ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms