Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARGC1AQ9UBK2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARGC1AQ9UBK2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms