Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUCLA2Q9P2R7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms