Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPM3Q9HCF6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPM3Q9HCF6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms