Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVMER34-1Q9H9K5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms