Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL3Q9H2J4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms