Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms