Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTMR12Q9C0I1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTMR12Q9C0I1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms