Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms