Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms