Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCMBPQ9BTE3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms