Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms