Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM20AQ96MK3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms