Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms