Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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