Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms