Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BCANQ96GW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
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