Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms