Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms