Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EAF2Q96CJ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EAF2Q96CJ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms