Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FAM3DQ96BQ1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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