Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms