Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms