Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL22A1Q8NFW1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms