Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD53Q8N9V6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms