Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCA5Q86VQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms