Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAPQ7Z569 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms