Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRADAQ7RTN6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms