Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TREML4Q6UXN2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms