Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms