Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCSD1Q6JBY9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms