Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLX4IPQ5VYV7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms