Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHSL1Q5SYE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms