Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBPF9Q3BBW0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms