Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MSMPQ1L6U9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms