Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MSMO1Q15800 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMO1Q15800 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms