Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NCOA1Q15788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NCOA1Q15788 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
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