Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALX1Q15699 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALX1Q15699 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALX1Q15699 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
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