Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 CIN8YEL061C 3003 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 snR76snR76 109 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 MTC3YGL226W 372 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 ACM1YPL267W 630 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 TFC4YGR047C 3078 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 BNR1YIL159W 4128 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 TRA1YHR099W 11235 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YPK1YKL126W 2043 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 REC8YPR007C 2043 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YLR278CYLR278C 4026 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 SNX41YDR425W 1878 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YDL068WYDL068W 330 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YLR434CYLR434C 384 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 TRM7YBR061C 933 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 MGR1YCL044C 1254 nt2.93□□□□□ -1.94 RIP-Chip
NOP56Q12460 MKT1YNL085W 2493 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 GCD10YNL062C 1437 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YJL016WYJL016W 1686 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 DIE2YGR227W 1578 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 TPS2YDR074W 2691 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 MMS1YPR164W 4224 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 DNL4YOR005C 2835 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YDR133CYDR133C 336 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 GPI14YJR013W 1212 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 RPL22AYLR061W 366 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 LCL2YLR104W 396 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 MRPL50YNR022C 420 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 YPR197CYPR197C 564 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 RPA190YOR341W 4995 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 SGM1YJR134C 2124 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 AKR1YDR264C 2295 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 DRS2YAL026C 4068 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 LRG1YDL240W 3054 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 SPC72YAL047C 1869 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 SEC22YLR268W 645 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 ATP15YPL271W 189 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 PSD2YGR170W 3417 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 NFT1YKR103W 3657 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 DUG2YBR281C 2637 nt2.9□□□□□ -1.94 RIP-Chip
NOP56Q12460 GNT1YOR320C 1476 nt2.9□□□□□ -1.94
NOP56Q12460 RAM2YKL019W 951 nt2.9□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 UBC7YMR022W 498 nt2.9□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 RGM1YMR182C 636 nt2.9□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YBR197CYBR197C 654 nt2.9□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 NUP82YJL061W 2142 nt2.9□□□□□ -1.95 RIP-Chip
NOP56Q12460 NAB3YPL190C 2409 nt2.9□□□□□ -1.95 RIP-Chip
NOP56Q12460 NCE101YJL205C 162 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YLR458WYLR458W 381 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 COX7YMR256C 183 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 PFF1YBR074W 2931 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 HFD1YMR110C 1599 nt2.88□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YDR250CYDR250C 276 nt2.88□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 AAD16YFL057C 459 nt2.88□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 RPL25YOL127W 429 nt2.88□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 STE6YKL209C 3873 nt2.88□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YTA7YGR270W 4140 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 GCV2YMR189W 3105 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YJL181WYJL181W 1836 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 GOT1YMR292W 417 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 ROG1YGL144C 2058 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 ASG1YIL130W 2895 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 IKI3YLR384C 4050 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 VPS52YDR484W 1926 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 PMR1YGL167C 2853 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YJR011CYJR011C 786 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 CCW14YLR390W-A 717 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YML003WYML003W 873 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YOR146WYOR146W 306 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 SMY2YBR172C 2223 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 ECM21YBL101C 3354 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 MSS11YMR164C 2277 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 RPS20YHL015W 366 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 RPL40AYIL148W 387 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 RPS22BYLR367W 393 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.85□□□□□ -1.95
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