Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms