Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms