Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms