Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YPL261CYPL261C 309 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 TOF1YNL273W 3717 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 ARK1YNL020C 1917 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 NAB3YPL190C 2409 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 KEL2YGR238C 2649 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 ALY1YKR021W 2748 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 PDR1YGL013C 3207 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 RNR4YGR180C 1038 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 PKR1YMR123W 369 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 AIM36YMR157C 768 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 HHT2YNL031C 411 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 JJJ2YJL162C 1752 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SMC6YLR383W 3345 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 POM152YMR129W 4014 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 APC11YDL008W 498 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 CRG1YHR209W 876 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 ARV1YLR242C 966 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 HRI1YLR301W 735 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 NGL1YOL042W 1092 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YPR012WYPR012W 255 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SSF2YDR312W 1362 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 TRA1YHR099W 11235 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SRO77YBL106C 3033 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 ERG28YER044C 447 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YER079WYER079W 633 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YAL037WYAL037W 804 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YLR269CYLR269C 351 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 RRT16YNL105W 429 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 FYV12YOR183W 390 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 MLH1YMR167W 2310 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 TRZ1YKR079C 2517 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 RPS26BYER131W 360 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YLR101CYLR101C 396 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YML108WYML108W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 FPR1YNL135C 345 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 DAD3YBR233W-A 285 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SPF1YEL031W 3648 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YDR186CYDR186C 2634 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SWA2YDR320C 2007 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 PDR11YIL013C 4236 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 ECL1YGR146C 636 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 PET191YJR034W 327 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 MRP49YKL167C 414 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YNL046WYNL046W 519 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YOL134CYOL134C 390 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 CDC33YOL139C 642 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YOL150CYOL150C 312 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SNF12YNR023W 1701 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SEC16YPL085W 6588 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 SDC25YLL016W 3147 nt2.4□□□□□ -2.02
RRN11Q04712 YDR269CYDR269C 324 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YKL066WYKL066W 444 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YOR050CYOR050C 348 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RGA1YOR127W 3024 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 AMS1YGL156W 3252 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 TRM2YKR056W 1920 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 MRD1YPR112C 2664 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 NPR3YHL023C 3441 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 APC2YLR127C 2562 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 HAA1YPR008W 2085 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 GLC7YER133W 939 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YPS5YGL259W 498 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YJR079WYJR079W 330 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 ARR2YPR200C 393 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 AYT1YLL063C 1425 nt2.39□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YER135CYER135C 393 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YHR138CYHR138C 345 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 TPM2YIL138C 486 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 PAU14YIL176C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 PAU1YJL223C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 TEN1YLR010C 483 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 PEX17YNL214W 600 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 OST2YOR103C 393 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 BFR1YOR198C 1413 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 ISU1YPL135W 498 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 snR191snR191 274 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 VTC3YPL019C 2508 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RGA2YDR379W 3030 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 MES1YGR264C 2256 nt2.38□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 STE11YLR362W 2154 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YGR050CYGR050C 357 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 FYV4YHR059W 393 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 BIG1YHR101C 1008 nt2.37□□□□□ -2.03
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