Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLCB3Q01970 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms