Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms