Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms