Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPI1P60174 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPI1P60174 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPI1P60174 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPI1P60174 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPI1P60174 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPI1P60174 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPI1P60174 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPI1P60174 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPI1P60174 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPI1P60174 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms