Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRPF1P55201 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms