Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK7P50613 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK7P50613 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK7P50613 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK7P50613 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK7P50613 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK7P50613 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK7P50613 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK7P50613 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK7P50613 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms